Завршио је Богословију Светог Саве у Београду. На Богословском факултету Српске православне цркве у Београду дипломирао је 1962. године. На Филозофском факултету у Београду студирао је класичну филологију. Постдипломске студије наставља у Берну и Риму. Одатле прелази у Атину, у којој, за време седмогодишњег боравка, поред парохијске службе, успева да докторира, а тезу на грчком језику о Светом Григорију Палами, брани уз највишу оцену. Потом годину дана проводи на Светој Гори, а онда је позван да предаје на Руском православном институту Свети Сергије у Паризу, од 1974. до 1976, где уз осталих пет језика које је савладао, усавршава и француски.
Замонашио се 1967. у Грчкој, где је 21. јула 1968. постао и јеромонах. По повратку у Београд, је изабран за декана Богословског факултета и ванредног професора, да би крајем 1985. године био рукоположен у чин епископа и постављен на катедри епископа банатских са седиштем у Вршцу, одакле је уочи Божића 1991. дошао на Цетиње када бива устоличен за Митрополита црногорско-приморског, зетско-брдског и скендеријског, и егзарха свештенога трона пећког. Након дуге комунистичке владавине, многи храмови и манастири у Црној Гори су били запуштени, а број свештеника и монаха на измаку. Митрополит Амфилохије је зато најпре подстакао обнову цркава и манастира и повећао број свештеника, монаха и монахиња. Покренуо је 1992. гласило Црногорско-приморске митрополије Светигора, широку издавачку активност, а и Радио Светигору 1998. године.
Предавао је на Богословском факултету у Београду од 1980. до 2005. године, када се повукао због мноштва обавеза. Поред теологије и филозофије, бави се есејистиком и преводилаштвом. По први пут у историји, митрополију су 1993. посетила два патријарха - цариградски и руски. Исте године први пут је Свети архијерејски сабор Српске Православне Цркве одржан у Митрополији црногорско-приморској. Почасни докторат Института Светог Сергија у Паризу добио је у фебруару 2012. године.
Митрополит Амфилохије је у болницу у Подгорици примљен 6. октобра 2020. године, због запаљења плућа узрокованог инфекцијом корона вирусом. Опоравак је текао у добром смеру, али нешто спорије. Митрополитово здравствено стање се нагло погоршало 29. октобра. Преминуо је сутрадан 30. октобра 2020. у 8:20 часова ујутру, у Клиничком центру Црне Горе, после примања свете тајне причешћа. Сахрањен је у крипти Саборне цркве Христовог васкрсења у Подгорици 1. новембра 2020. године.
Поводом пете годишњице упокојења блаженопочившег Митрополита Амфилохија 30. октобра у Саборном храму Христовог Васкрсења у Подгорици Свету архијерејска литургију служиће Његово високопреосвештенство Митрополит црногорско-приморски г. Јоаникије са више архијереја.Помен Митрополиту Амфилохију служиће се у крипти Саборног храма – у параклису Светог Амфилохија Иконијског са почетком у 11 сати.
